在R虚拟环境?
从代码移动到新机器(可能运行不同的OS)相对简单并且给出相同结果的意义上来说,主要的工作之一就是确保代码的可移植性。
来自Python背景,我习惯了虚拟环境的概念。与所需软件包的简单列表一起使用时,这可以确保安装的软件包和库在任何计算机上都可用,而不会引起太多麻烦。当然,这不能保证-
不同的操作系统都有自己的缺点和特点-但这可以为您提供95%的解决方案。
R中是否存在这样的东西?即使它不那么复杂。例如,仅维护必需软件包的纯文本列表以及将安装所有缺失软件包的脚本?
我即将开始认真使用R,可能与Sweave结合使用,并且理想情况下,我希望以最佳方式开始!感谢您的想法。
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我将使用@cboettig发表的评论来解决此问题。
Packrat
Packrat是R的依赖项管理系统。它为您提供三个重要的优点(所有这些优点都针对您的可移植性需求)
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隔离:为一个项目安装新的或更新的软件包不会破坏您的其他项目,反之亦然。这是因为packrat为每个项目提供了自己的私有软件包库。
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可移植:可以轻松地将项目从一台计算机传输到另一台计算机,甚至可以跨不同的平台进行。Packrat使您可以轻松安装项目所依赖的软件包。
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可重现:Packrat记录您所依赖的确切软件包版本,并确保无论您身在何处都可以安装这些确切版本。
下一步是什么?
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将Packrat与RStudio结合使用:http ://rstudio.github.io/packrat/rstudio.html
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