从以下位置获取Python错误:无法读取/ var / mail / Bio
发布于 2021-01-29 15:18:25
我正在运行(bio)python脚本,导致以下错误:
from: can't read /var/mail/Bio
看到我的脚本与邮件没有任何关系,我不明白为什么我的脚本在/ var / mail中查找。
这里似乎是什么问题?我怀疑这会有所帮助,因为脚本似乎不是问题所在,但是无论如何这是我的脚本:
from Bio import SeqIO
from Bio.SeqUtils import ProtParam
handle = open("examplefasta.fasta")
for record in SeqIO.parse(handle, "fasta"):
seq = str(record.seq)
X = ProtParam.ProteinAnalysis(seq)
print X.count_amino_acids()
print X.get_amino_acids_percent()
print X.molecular_weight()
print X.aromaticity()
print X.instability_index()
print X.flexibility()
print X.isoelectric_point()
print X.secondary_structure_fraction()
这里有什么问题?错误的python设置?我真的不认为这是脚本。
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