Python Pandas:增加最大行数
我正在处理一个大型文本文件(500k行),其格式如下:
S1_A16
0.141,0.009340221649748676
0.141,4.192618196894668E-5
0.11,0.014122135626540204
S1_A17
0.188,2.3292323316081486E-6
0.469,0.007928706856794138
0.172,3.726771730573038E-5
我正在使用下面的代码返回每个系列的相关系数,例如S!_A16:
import numpy as np
import pandas as pd
import csv
pd.options.display.max_rows = None
fileName = 'wordUnigramPauseTEST.data'
df = pd.read_csv(fileName, names=['pause', 'probability'])
mask = df['pause'].str.match('^S\d+_A\d+')
df['S/A'] = (df['pause']
.where(mask, np.nan)
.fillna(method='ffill'))
df = df.loc[~mask]
result = df.groupby(['S/A']).apply(lambda grp: grp['pause'].corr(grp['probability']))
print(result)
但是,在一些大文件上,这将返回错误:
Traceback (most recent call last):
File "/Users/adamg/PycharmProjects/Subj_AnswerCorrCoef/GetCorrCoef.py", line 15, in <module>
print(result)
File "/Users/adamg/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pandas/core/base.py", line 35, in __str__
return self.__bytes__()
File "/Users/adamg/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pandas/core/base.py", line 47, in __bytes__
return self.__unicode__().encode(encoding, 'replace')
File "/Users/adamg/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pandas/core/series.py", line 857, in __unicode__
result = self._tidy_repr(min(30, max_rows - 4))
TypeError: unsupported operand type(s) for -: 'NoneType' and 'int'
我了解这与该print
声明有关,但是如何解决?
编辑 :这与最大行数有关。有谁知道如何容纳更多的行?
-
错误信息:
TypeError: unsupported operand type(s) for -: 'NoneType' and 'int'
说
None
负一个int
是TypeError。如果查看回溯中的倒数第二行,您会发现唯一的减法是max_rows - 4
所以
max_rows
一定是None
。如果您进入/Users/adamg/anaconda/lib/python2.7/site- packages/pandas/core/series.py
857号线附近,问自己如何max_rows
最终等于None
,您会以某种方式看到get_option("display.max_rows")
一定在返回
None
。这部分代码正在调用
_tidy_repr
,用于总结系列。None
是正确的值来设定的,当你想熊猫来显示 所有
的线Series
。因此,如果max_rows
为None ,则不应到达代码的这一部分。我已提出请求以更正此问题。