test_sample_vs_group.py 文件源码

def expected_result():
    contents = """Sample OtherGroup
0    GENE1_KO_ChIP_1    GENE2_KO
1    GENE1_KO_ChIP_1         WT
2    GENE1_KO_ChIP_2    GENE2_KO
3    GENE1_KO_ChIP_2         WT
4    GENE1_KO_ChIP_3    GENE2_KO
5    GENE1_KO_ChIP_3         WT
6   GENE2_KO_ChIP_1     GENE1_KO
7   GENE2_KO_ChIP_1         WT
8   GENE2_KO_ChIP_2     GENE1_KO
9   GENE2_KO_ChIP_2         WT
10  GENE2_KO_ChIP_3     GENE1_KO
11  GENE2_KO_ChIP_3         WT
12       WT_ChIP_1     GENE1_KO
13       WT_ChIP_1    GENE2_KO
14       WT_ChIP_2     GENE1_KO
15       WT_ChIP_2    GENE2_KO
16       WT_ChIP_3     GENE1_KO
17       WT_ChIP_3    GENE2_KO"""

    return pd.read_table(StringIO(contents), sep="\s+", index_col=0)